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2020年7月17日

12092:日本人網膜色素変性症患者におけるRP1遺伝子への創始者Alu挿入:論文紹介

清澤のコメント:JJOの論文を採録したメールが送られてきました。東北大の方々の名前のある論文でしたので抄録を翻訳してみました。概要はわかるのですが「founder Alu insertion」という語の意味が私には今一つ理解できていません。


A founder Alu insertion in RP1 gene in Japanese patients with retinitis pigmentosa
Koji Miura Nishiguchi, Kosuke Fujita, Yasuhiro Ikeda, Hiroshi Kunikata, Yoshito Koyanagi, Masato Akiyama, Toshiaki Abe, Yuko Wada, Koh-Hei Sonoda & Toru Nakazawa
Japanese Journal of Ophthalmology volume 64, pages346–350(2020)
公開日:2020年3月19日
日本人網膜色素変性症患者におけるRP1遺伝子への創始者Alu挿入
Japanese Journal of Ophthalmology 64巻、346〜350頁(2020年)

概要
目的
以前に遺伝子にヘテロ接合性の有害な変異があることが確認されている網膜色素変性症(RP)患者のグループのRP1における328 bp Alu挿入(c.4052_4053ins328、p.Tyr1352Alafs)をスクリーニングします。

研究デザイン
前向き、臨床および実験的研究。

方法
RP1のAlu挿入は、先行する遺伝子研究で特定されたRP1にヘテロ接合性の有害な変異(ナンセンスまたはフレームシフト)を持つ26人のRP患者で、最適化されたPCRベースの方法でスクリーニングされました。以前に同定された突然変異の遺伝的位置とその遺伝パターンが評価されました。

結果
RP1にヘテロ接合性の有害な変異を有する26人のRP患者のうち、5人(19.2%)が追加のヘテロ接合性Alu挿入を保有しており、おそらく複合ヘテロ接合性状態をもたらした。これには、遺伝的所見に基づいて常染色体優性RPと以前に診断されていた3人の患者が含まれていました。彼らは我々の新しい発見に続いて常染色体劣性疾患であると再診断されました。 Alu挿入で識別されたすべての患者で、先行研究で見つかった他の変異は、トランケーション変異が優勢な負の効果を発揮することが示唆されているエクソン4(アミノ酸677から917をコードする)の定義領域外にありました。

結論
創始者のRP1へのAlu挿入は、日本人患者における常染色体劣性RPの重要な原因であり、標準的なターゲットリシーケンスでは見逃される可能性があります。この変異のために最適化されたスクリーニングは、特にRP1のエクソン4の定義された領域の外側にあるヘテロ接合性の有害な変異を有する患者において保証されます。

Categorised in: 糖尿病網膜症・加齢黄斑変性 (網膜疾患)