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2020年2月8日

11493:新型コロナウイルススパイク蛋白遺伝子の挿入部位とHIV-1との不思議な類似性:だそうです

眼科医清澤のコメント:神王TVでは、今回の新型コロナウイルスが生物兵器に関連するものなのか?という事を話題にしています。その中で査読を経ていない論文をまとめるサイトの記事を紹介しています。その記事はいったんPDFで公開されたのちに( https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1.full.pdf )、著者らの意思で削除されていますが、それはこの内容が事実とすれば重要なことを示唆してしまうからだろうと推測することが可能です。眼科医とはいえ、その削除された記事の内容を閲覧することは可能でしたので、そのアブストラクトとイントロダクション部分を翻訳してここに採録して見ました。興味ある方は元論文PDFを見てください。

ーーー引用ーーー

2019-nCoVスパイクタンパク質のユニークな挿入とHIV-1 gp120およびGagとの不思議な類似性 

Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag
Prashant Pradhanインド、ニューデリー-110016、インド工科大学、クスマ生物科学部、

概要:
現在、2019年の新規コロナウイルス(2019-nCoV)による大流行を目の当たりにしています。 2019-nCoVの進化はとらえどころのないままです。 2019-nCoVに固有であり、他のコロナウイルスには存在しないスパイク糖タンパク質(S)に4つの挿入が見つかりました。
重要なことに、4つのインサートすべてのアミノ酸残基は、HIV1 gp120またはHIV-1 Gagのアミノ酸残基と同一または類似しています。興味深いことに、遺伝子挿入が一次アミノ酸配列で不連続であるにもかかわらず、2019-nCoVの3次元構造は、それらが受容体結合部位を構成するように収束することを示唆しています。 HIV-1の主要な構造タンパク質のアミノ酸残基と同一性/類似性を有する2019-nCoVの4つのユニークな遺伝子挿入の発見は、自然界では偶然ではありません。この研究は、2019-nCoVに関する未知の洞察を提供し、このウイルスの診断と重要な意味を持つこのウイルスの進化と病原性に光を当てます。

前書き
コロナウイルス(CoV)は、動物や人間に感染する一本鎖のプラスセンスRNAウイルスです。これらは、宿主特異性に基づいて、4つの属に分類されます:アルファコロナウイルス、ベータコロナウイルス、デルタコロナウイルス、およびガンマコロナウイル(Snijder et al、2006)。 229EおよびNL63 (Alphacoronavirus属)、OC43、HKU1、MERSおよSARS(Betacoronavirus属)を含む7種類の既知のCoVがあります。 229E、 NL63、OC43、およびHKU1は一般にヒトに感染しますが、2002年と2012年のSARSとMERSのアウトブレイクは、それぞれウイルスが動物からヒトにクロスオーバーしたときに発生し、重大な死亡を引き起こしました(J. Chan et al、and; JFW Chan et al、2015)。 2019年12月、コロナウイルスの別の発生が 動物から人間にも感染した中国の武漢で報告されました。この新しいウイルスは、世界保健機関(WHO)によって一時的に2019-新規コロナウイルス(2019-nCoV)と呼ばれています(J. F.- W. Chan等、2020; Zhu等、2020)。 2019-nCoVの起源についていくつかの仮説がありますが、この進行中の発生の原因はとらえどころのないままです。
2019-nCoVの伝播パターンは、ウイルスに感染した人との身体またはエアロゾルの接触を含む、以前のアウトブレイクで記録された伝播パターンに類似しています。

CC-BY-NC-ND 4.0 Internationalライセンスの下で利用可能です。査読なしのプレプリントは著者/創設者で、bioRxivにプレプリントを永続的に表示するライセンスを付与しています。
このbioRxivプレプリントは2020年1月31日に この著作権者によってオンラインで最初に掲載されました。 doi:http://dx.doi.org/10.1101/2020.01.30.927871

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927871v1.full.pdf
軽度から重度の病気、および感染による死亡が武漢から報告されています。このアウトブレイクは、フランス、オーストラリア、アメリカなど、遠く離れた国々に急速に広がりました。
中国内外の症例数は急増しています。私たちの現在の理解は、ウイルスのゲノム配列と控えめな疫学的および臨床データに限定されています。
利用可能な2019-nCoVシーケンスの包括的な分析は、進行中のアウトブレイクを管理するための現在の理解を深めるのに役立つ重要な手がかりを提供します。
コルナナウイルスのスパイク糖タンパク質(S)は、2つのサブユニット(S1およびS2)に切断されます。 S1サブユニットは受容体の結合を助け、S2サブユニットは膜融合を促進します(Bosch et al、2003; Li、2016)。コロノウイルスのスパイク糖タンパク質は、組織向性と宿主域の重要な決定因子です。さらに、スパイク糖タンパク質はワクチン開発の重要なターゲットです(Du et al、2013)。このため、スパイクタンパク質はコロナウイルスの中で最も広範囲に研究されています。したがって、計算ツールを使用して、2019-nCoVのスパイク糖タンパク質を調査して、その進化、新しい機能シーケンス、および構造的機能を理解しようとしました。

bioRxiv(バイオアーカイヴ)は2013年11月に開始された生物学のプレプリントリポジトリである。

及川幸久氏も似たことを言っていますね。

Categorised in: 全身病と眼